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生态功能区是指具有特定生态环境并能发挥一定生态功能的地理区域。划分生态功能区的目的是有针对性地对其进行保护和开发、建设，充分发挥其生态功能，以生态建设为主，做到保护与开发协调，防止生态破坏，阻止生态退化和功能丧失，维护生态平衡，最终达到经济效益、生态效益和社会效益的统一，为人类创造优美的生存环境。
大小兴安岭地区是全球生态系统的重要组成部分，是我国东北、华北的生态屏障，具有极为重要的生态价值。该区是我国历史上形成最早的森林区域，也是独存的地处寒温带的生态功能区。特有的物种多样性，具有极高的生态价值、人文价值和巨大的潜在利用价值。耕地面积和每年生产的粮食都占黑龙江省的80%以上，是我国21世纪发展的木材供应、淡水资源与矿产资源基地。目前，该区还是哈尔滨、大庆、齐齐哈尔及国家级扎龙湿地保护区的水源补给地，从长远看，把黑龙江支流引入嫩江水系，无疑是未来实施北水南调工程，缓解吉、辽水资源短缺问题的重要选择之一。
该区是我国极为重要的碳储库和碳纳库。在国际社会关于温室气体减排谈判中，森林储碳、纳碳能力，已经作为一种积极的、有效的减排手段的背景下，森林面积占全国6.5%，占全省68%的大小兴安岭地区，在为我国未来经济增长赢得更大的生态空间方面具有举足轻重、不可替代的作用。该区蕴藏着丰富的生态资源、生物多样性和珍稀、濒危野生动植物资源，是我国重要的林业生产基地、野生动植物种类资源圃和基因库。同时，黑龙江省嫩江、松花江、黑龙江等水系及其主要支流的重要源头水源涵养区，是松嫩平原和三江平原、呼伦贝尔草原的重要生态屏障，具有重要的涵养水源、保持水土、调蓄洪水、维持生物多样性等生态功能。对维持区域生态协调、保障生态安全具有极其重要的作用。
依据地形、地貌、地质等地理特征显著不同，水文、气象有明显差别，生物及其生态类型有明显区别，生态功能及社会经济功能和开发利用趋势不同，结合国土区划、植被区划、土壤利用规划等历史区（规）划。以定性分区和定量分区相结合，综合考虑各方面因素，采用叠置法进行分区划界，将大小兴安岭划分为2大生态区、3个亚区、6个生态功能区。各生态功能区分布位置如图6-5所示。
在国家的大生态区划中黑龙江流域处于“东部湿润、半湿润生态大区”。从中等尺度气候及降水、地貌类型方面来划分，可划分为2个生态区，即，寒温带湿润山地针叶林生态区和温带湿润平原阔叶林生态区。根据气候、植被状况及生态类型，可划分为3个生态亚区，即，大兴安岭北部寒温带山地湿润针叶林生态亚区、小兴安岭东北部温带山地湿润针阔叶混交林生态亚区和三江平原湿润阔叶混交林与湿地生态亚区。根据生态服务功能重要性、生态敏感性、生态环境问题划分为6个生态功能区，即，大兴安岭北部山地森林生态水源涵养、气候调节与生物多样性保护生态功能区；大兴安岭北部沿江农业水土保持生态功能区；小兴安岭东北部山地森林生态水源涵养、气候调节与生物多样性保护生态功能区；小兴安岭沿江农业水土保持生态功能区；三江平原湿地生态与水文调蓄生态功能区和三江平原农业水土保持生态功能区。
因此，大、小兴安岭区域经济的发展应以森林、矿业和农牧业综合开发利用为主。目前，由于国家林业政策的影响，森林的开发受到限制，林业、农牧业对区域经济发展和财政的贡献十分有限。因此，加大财政支持力度，合理规划，科学地开发矿产资源，走“绿色矿业”，之路，形成“绿色矿业财源”，是该地区经济可持续发展的必经之路。
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